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基于非线性SUR模型的猕猴桃生长曲线研究

日期:11-01 来源:网络收集 点击次数: 提醒:需要原创365bet官网4118.vip_365bet体育在线世爵_365bet手机版请联系客服
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 摘 要:本文从建模的角度分析“碧玉”猕猴桃果实纵横径的生长数据,给出适合该数据的一种非线性SUR模型。【365bet官网4118.vip_365bet体育在线世爵_365bet手机版365bet官网4118.vip_365bet体育在线世爵_365bet手机版就找123yC.cOm原创365bet官网4118.vip_365bet体育在线世爵_365bet手机版网,QQ:562.239.41】将纵径和横径的生长看成一个整体,利用非线性SUR模型模拟其生长过程,通过R语言编写程序,求出模型中参数的极大似然估计及模型的拟合优度。得到猕猴桃果实纵径和横径的生长曲线,说明本文非线性SUR模型的有效性。
  关键词: 非线性;SUR模型;猕猴桃;生长曲线
  中图分类号:O212 文献标识码:A DOI:10.11974/nyyjs.20180333003
  引言
  SUR(Seemingly Unrelated Regression)回归模型[1]也称半相依回归模型,是联立方程模型,方程之间因误差项的跨方程相关而互相联系,在生物、遗传、医学等领域都有重要应用[2]。有关SUR模型的统计研究已有很多成果,如文献[3-5],其中文献[5]系统研究了线性和非线性SUR模型及其在医学中的应用,并指出当模型中方程间的非线性函数形式不同时,SUR模型下的参数估计优于普通非线性最小二乘估计。
  对植物及其果实的生长动态进行研究有助于掌握植物的生长发育规律,而植物生长曲线的拟合可以直观的表现其生长动态。目前有关植物生长动态的研究已有大量成果,如文献[6]在温室与露地2种环境下对无核早红葡萄的生长动态进行了比较研究,文献[7]利用二次曲线分别对“碧玉”猕猴桃果实纵径和横径的生长动态进行了曲线拟合。
  针对文献[7]提供的生长数据,本文基于非线性SUR模型,充分利用模型中不同方程提供的信息,将纵径和横径的生长看成一个整体,利用R语言(版本3.3.3)编写程序,运用拟牛顿算法(BFGS)得到了非线性SUR模型参数的极大似然估计值,绘制出“碧玉” 猕猴桃果实纵径和横径的生长曲线,进一步分析了猕猴桃果实纵径和横径的生长规律。
  1 非线性SUR模型
  一般的,非线性SUR模型的形式[8]为
  (1)
  其中,yi=(yi1,yi2,…,yin)为的观测数据,ti=(ti1,ti2,…,tin)为的观测时间,是待估参数向量,是非线性函数,ei=(ei1,ei2,…,ein)为的误差向量,i=1,2,…,m,V为协方差矩阵。
  本文考虑如下含2个方程的非线性SUR模型
  (2)
  其中是第1个方程中的待估参数,ai(i=0,1,2,3,4)是第2个方程中的待估参数;协方差矩阵表示∑与In的
  Kronecker乘积,
  模型(2)中的2个方程的非线性函数表达式不统一,且随机误差具有相关性 。如果不同方程的非线性函数表示不同群体的拟合曲线,则此模型表示第1个群体的拟合曲线为Logistic曲线,第2个群体的拟合曲线为多项式曲线,均可表示群体的“S”型生长曲线。
  如记
  则模型(2)可表示为
  (3)
  2 参数估计及拟合优度检验
  记模型(3)中的未知参数向量为
  ,其对数似然函数为
  其中,
  本文中,模型(3)中未知参数向量包含11个参数,极大似然估计记为
  要求其具体表达式很繁琐,甚至有些参数的极大似然估计并求不出显式解,对于具体的实际问题,可借助于计算机软件求解更为方便。本文基于R语言利用拟牛顿算法(BFGS)求各参数的极大似然估计值。
  将参数的极大似然估计值代入模型中各方程,便可得2个相关群体的拟合曲线,进而可对2群体的生长动态进行整体把握。对每一方程或群体的拟合曲线,利用决定系数
  和统计量来
  判断曲线拟合的优劣程度,其中表示第个个体的实测数据,为拟合值。越接近于1,或对给定的显着性水平,若,则表示曲线拟合的越好[9]。
  3 猕猴桃果实生长趋势分析
  不同品种的猕猴桃果实,其生长曲线可能会不同。一般猕猴桃果实纵横径的生长趋势呈“S”或“双S”型曲线[10]。有关不同品种猕猴桃果实的生长曲线已有大量文献对其研究,但大多都是单独描述某一性状且只描述其生长的动态变化过程,绘制出折线图,并没有给出拟合度较高的生长曲线。文献[7]以直线和二次多项式分别对猕猴桃果实纵径和横径的生长曲线进行拟合,尽管二次多项式的拟合优度R2较高,均在0.9以上,但实际上其拟合效果并不好。
  同一果实的纵径和横径的生长存在高度相关性,将纵径和横径的生长看成一个整体,而不是孤立的分析他们各自的生长过程更符合实际。针对文献[7]中的“碧玉”猕猴桃果实纵横径的生长数据(图1、表1),纵径与横径的相关系数为0.9883095,通过其散点图(图1)发现,纵横径的生长趋势均呈“S”型曲线,利用R语言编写程序对纵横径生长数据单独进行曲线拟合,发现利用Logistic曲线和四次多项式曲线分别描述其生长趋势效果较好。为使得拟合效果更好,本文选择在非线性SUR模型(2)的框架下,将纵径和宽横径的生长看成一个整体,充分利用不同方程提供的信息,在R语言中,根据拟牛顿算法,求出模型(2)中各参数的极大似然估计值(表2),进而得到纵 径和横径生长的拟合数据(表1),拟合纵径和横径的生长曲线(图1),并求出模型的拟合优度(表2),为猕猴桃果实的生长发育过程提供一定的参考,也进一步说明本文模型的有效性。

关键词:猕猴桃?曲线?模型?生长?SUR

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